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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-04 16:58:25, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A01.
CP030983.1:14557865-14557891
AATTTAACGAAAATGGAGTTTAATTTTGTT14557865GGACAGTCAACAACGTTTTATATACTTTAATTACATTCATTTTTTTACGCAATCAAT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B01.
CP030993.1:18545528-18545554
AATTTAACGAAAATGGAGTTTAATTTTGTT18545528GGACAGTCAACAACGTTTTATATACTTTAATTACATTCATTTTTTTACGCAATCAAT
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 01.
CP049892.1:19197049-19197075
AATTTAACGAAAATGGAGTTTAATTTTGTT19197049GGACAGTCAACAACGTTTTATATACTTTAATTACATTCATTTTTTTACGCAATCAAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGTATATAAAACGTTGTTGACTGTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGTATATAAAACGTTGTTGACTGTCC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.096 | 0.087 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGTATATAAAACGTTGTTGACTGTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.110 | 0.014 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGACAGTCAACAACGTTTTATATACTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.112 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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