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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 06:04:46, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Sambucus nigra genome assembly, chromosome: 8.
OX422214.1:43214950-43214970
GGATTTAAAGACACCCAATTTGGTACATGA43214950AATGCAGGGTTTCAAGTGTGTCACTCTCTTGGAGGTGGAATGGGATCTGGA
Sambucus nigra genome assembly, chromosome: 6.
OX422212.1:342262724-342262744
TCCAGATCCCGTTCCACCTCCAAGAGAGTG342262724ACACACTTGAAACCCTGCATTTCATGTACCAAATTGGGCGTCTTTAAAACC
Sambucus nigra genome assembly, chromosome: 11.
OX422217.1:323243156-323243176
TCCAGATCCCATTCCACCTCCAAGAGAGTG323243156ACACACTTGAAACCCTGCATTTCATGTACCAAATTGGGCGTCTTTAAAGCC
Sambucus nigra genome assembly, chromosome: 15.
OX422221.1:184896472-184896492
TAGAGTTCCCATTCCATCTCCAAGAGAGTG184896472ACACACTTGAAACCCTGCATTTCATGTACCAAATTAGGCGTCATTAAATCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AATGCAGGGTTTCAAGTGTGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGCAGGGTTTCAAGTGTGT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.104 | 0.095 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATGCAGGGTTTCAAGTGTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.130 | 0.026 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACACACTTGAAACCCTGCATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.132 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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