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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 09:28:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL073a08_r, 5'end.
AU195299.1:214-233
CCTGGTGGAGGCGGGCTGGCGCCAGCGGCC214ACCGTGGCAGCCATAGATATGTCGAGCGAGTGCCACGAGAGTCTTTTTGT
py593 PY Sporophyte cDNA Library Pyropia yezoensis cDNA, mRNA sequence.
CX874353.1:92-111
ACAAAAAGACTCTCGTGGCACTCGCTCGAC92ATATCTATGGCTGCCACGGTGGCCGCTGGCGCCAACCCGCCTCCACCAGG
py801 PY Sporophyte cDNA Library Pyropia yezoensis cDNA, mRNA sequence.
CX874522.1:80-99
ACAAAAAGACTCTCGTGGCACTCGCTCGAC80ATATCTATGGCTGCCACGGTGGCCGCTGGCGCCAACCCGCCTCCACCAGG
pyF4 PY Sporophyte cDNA Library Pyropia yezoensis cDNA, mRNA sequence.
CX874580.1:91-110
ACAAAAAGACTCTCGTGGCACTCGCTCGAC91ATATCTATGGCTGCCACGGTGGCCGCTGGCGCCAACCCGCCTCCACCAGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACCGTGGCAGCCATAGATAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACCGTGGCAGCCATAGATAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.103 | 0.094 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCGTGGCAGCCATAGATAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.220 | 0.117 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATATCTATGGCTGCCACGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.222 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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