GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-07 20:41:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Zeus faber genome assembly, chromosome: 2.
OY482846.1:46803519-46803537
AGGTGCCCCTGACCGAGGCACTGGCAAAAG46803519AGCTGAAGTTGGTCCCTGGACGCTGCACTGCGGCTGCCCACAGCTCCTA
Sequence 4733 from Patent EP2194140.
HC894581.1:338-356
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG338AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Sequence 17997 from Patent EP2194140.
HC907844.1:338-356
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG338AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Sequence 4733 from patent US 8952217.
HK423034.1:338-356
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG338AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Sequence 17997 from patent US 8952217.
HK429596.1:338-356
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG338AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Sequence 32484 from patent US 8952217.
HK436745.1:338-356
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG338AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Sequence 40003 from patent US 8952217.
HK440465.1:338-356
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG338AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Sequence 64270 from patent US 8952217.
HK452458.1:338-356
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG338AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
c.12.N16.5 CM523-7 cassava lambda zap Manihot esculenta cDNA 5', mRNA sequence.
CK646747.1:273-291
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG273AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_001_N16, 5'end.
DB920354.1:308-326
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG308AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_002_J13, 5'end.
DB920620.1:318-336
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG318AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_002_N20, 5'end.
DB920713.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_003_M02, 5'end.
DB921036.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_005_H10, 5'end.
DB921637.1:372-390
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG372AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_006_A14, 5'end.
DB921845.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_006_F22, 5'end.
DB921969.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_008_I20, 5'end.
DB922766.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_008_J22, 5'end.
DB922792.1:372-390
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG372AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_009_M02, 5'end.
DB923202.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_011_O11, 5'end.
DB923978.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_013_D20, 5'end.
DB924452.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_014_I06, 5'end.
DB924923.1:439-457
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG439AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_014_K18, 5'end.
DB924980.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_016_M03, 5'end.
DB925730.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_018_N08, 5'end.
DB926480.1:328-346
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG328AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_019_C19, 5'end.
DB926604.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_020_I06, 5'end.
DB927084.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_020_J20, 5'end.
DB927119.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_020_K24, 5'end.
DB927145.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_021_N08, 5'end.
DB927560.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_025_C19, 5'end.
DB928757.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_026_C23, 5'end.
DB929115.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_026_H09, 5'end.
DB929219.1:357-375
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG357AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_026_I14, 5'end.
DB929248.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_026_I18, 5'end.
DB929252.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_031_P04, 5'end.
DB931220.1:330-348
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG330AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_032_N09, 5'end.
DB931550.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_033_J09, 5'end.
DB931828.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_034_I22, 5'end.
DB932190.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_035_H02, 5'end.
DB932508.1:353-371
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG353AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_035_H08, 5'end.
DB932513.1:372-390
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG372AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_035_H20, 5'end.
DB932525.1:308-326
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG308AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCA
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_035_P10, 5'end.
DB932699.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_036_M23, 5'end.
DB933012.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_038_B12, 5'end.
DB933481.1:308-326
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG308AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_038_F15, 5'end.
DB933563.1:372-390
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG372AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_040_B23, 5'end.
DB934205.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_041_G18, 5'end.
DB934693.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_043_H03, 5'end.
DB935440.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_044_G23, 5'end.
DB935796.1:318-336
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG318AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_046_B02, 5'end.
DB936401.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_046_D18, 5'end.
DB936460.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_046_H02, 5'end.
DB936532.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_046_J02, 5'end.
DB936577.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_046_N15, 5'end.
DB936676.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_047_C06, 5'end.
DB936777.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_047_N22, 5'end.
DB937018.1:24-42
CGAATGAATTTAATCTTTGTTGG24AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mRNA, clone: CAS01_047_O23, 5'end.
DB937041.1:362-380
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG362AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Rattus norvegicus DNA, BAC clone: RNB1-304E23, 3'end.
DH732867.1:59-77
AAACAAAGTAGGCATTTCCTGAAAAGTGAC59AGCTGAAGTTGGTCCCTGGTCTCTGTGCCATGATGCACATGGGCACACA
MH141B09-MF MECABa Manihot esculenta genomic, genomic survey sequence.
HR882932.1:476-494
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG476AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
MH151I01-MF MECABa Manihot esculenta genomic, genomic survey sequence.
HR902569.1:483-501
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG483AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
MH041B09b-MF MECABa Manihot esculenta genomic, genomic survey sequence.
JM107930.1:419-437
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG419AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Rattus norvegicus clone CH230-162K10, WORKING DRAFT SEQUENCE.
AC115353.5:141381-141399
AAACAAAGTAGGCATTTCCTGAAAAGTGAC141381AGCTGAAGTTGGTCCCTGGTCTCTGTGCCATGATGCACATGGGCACACA
Chrysoporthe puriensis isolate CMW54409 chromosome 4.
CP064897.1:1336953-1336971
AGCGAGATACTCGATCATACTTGTCTTTCC1336953AGCTGAAGTTGGTCCCTGGATGAGAATGGGAAACCGCCTCGTCGATGTG
Manihot esculenta clone POYE303-1 granule-bound starch synthase I (gbssI) gene, partial cds.
HM038439.1:165-183
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG165AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta granule-bound starch synthase I (GBSSI) gene, complete cds.
JF708948.1:383-401
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG383AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Manihot esculenta mutant granule-bound starch synthase I (GBSSI) gene, complete cds.
JF708949.1:406-424
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG406AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT
Pseudopediastrum boryanum genome assembly, chromosome: 6.
OY744498.1:3448277-3448295
GTATAAAGCACCTCCGACCGAGGCATCAGC3448277AGCTGAAGTTGGTCCCTGGATATGACCAGGAGCTTCGCGGATAAGGCAG
M.esculenta mRNA for granule-bound starch synthase.
X74160.1:338-356
TGGTCATGGAATGAATTTAATCTTTGTTGG338AGCTGAAGTTGGTCCCTGGAGCAAAACTGGTGGACTTGGTGATGTTCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCTGAAGTTGGTCCCTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCTGAAGTTGGTCCCTGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
3.334 | 3.325 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCTGAAGTTGGTCCCTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
3.396 | 0.062 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAGGGACCAACTTCAGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=0
3.396 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).