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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 17:55:05, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

sh82f05.y1 Gm-c1016 Glycine max cDNA clone GENOME SYSTEMS CLONE ID: Gm-c1016-6682 5', mRNA sequence.
AW432763.1:336-355
ACAAGCCTTTCATTTATTCATAAAGAAGCA336AGTGGGATATCTTGGGCATGACTCATATTTTACAG
GM700013A20D10 Gm-r1070 Glycine max cDNA clone Gm-r1070-5156 3', mRNA sequence.
BE820963.1:121-140
AACCACATATATTATCTGTAAAATATGAGT121CATGCCCAAGATATCCCACTTGCTTCTTTATGAATAAATGAAAGGCTTGT
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 4.
CP126429.1:6206000-6206019
AACCACATATATTATCTGTAAAATATGAGT6206000CATGCCCAAGATATCCCACTTGCTTCTTTATGAATAAATGAAAGGCTTGT
Geum urbanum genome assembly, chromosome: 6.
OX327002.1:55306891-55306910
CATCAACCTGGACTCCTTGAGCAGAAATTA55306891CATGCCCAAGATATCCCACTGAGGGCTGTCCAAAAGAGCACTTTGATGGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGTGGGATATCTTGGGCATG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGTGGGATATCTTGGGCATG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.103 | 0.094 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGTGGGATATCTTGGGCATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.128 | 0.025 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATGCCCAAGATATCCCACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.130 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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