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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-05 01:03:18, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Geotrypetes seraphini genome assembly, chromosome: 3.
LR699148.1:169308449-169308468
AAAATGGATGCGGTGCTCAGCATGATGTCT169308449ATGCTGGTATGCACTTTGCAAAACAGTTTCCCAAAATACCAGCAGTGCTC
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 7.
CP093349.1:39123488-39123507
GTCAAAATTGGTAATGTAATTTATAAGTAC39123488TGCAAAGTGCATACCAGCATCTGCATATGCCAATCTCCTCTATGACTTAA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 7.
CP125307.1:39197078-39197097
GTCAAAATTGGTAATGTAATTTATAAGTAC39197078TGCAAAGTGCATACCAGCATCTGCATATGCCAATCTCCTCTATGACTTAA
Mythimna ferrago genome assembly, chromosome: 10.
OU342683.1:10708451-10708470
AACATAGCATATGTAAATCAATCAATATTT10708451TGCAAAGTGCATACCAGCATTTTAATTTAACGACTTTTTTATTATGTTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGCTGGTATGCACTTTGCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGCTGGTATGCACTTTGCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.099 | 0.090 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGCTGGTATGCACTTTGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.131 | 0.032 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCAAAGTGCATACCAGCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.133 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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