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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-07 12:43:38, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Ctenomys sociabilis 336348.Ctso mRNA sequence.
JU558968.1:347-366
TGCCAGATATTACAGAGTGCCAGGAGAAAG347ATGTCCTCTGTATGTTTGAAGCTGAAATGCAATGGAAAAGAGACTATCTA
Muscardinus avellanarius genome assembly, chromosome: 7.
OY726564.1:41257156-41257175
ACCTTTACCATTTCTGCTCACTAGCTGTGT41257156TTCAAACATACAGAGGACATTTTGCAGGCAATACCATGTTTTGTGTTTGT
Pinus pinaster root EST, clone RS43B11.
BX680414.1:566-585
ATCATGATGTTCGCATCCGTGACCACATTG566TTCAAACATACAGAGGACATAACCAGGGAGGTTTGTGGATTGAAATGGTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGTCCTCTGTATGTTTGAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGTCCTCTGTATGTTTGAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.116 | 0.107 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGTCCTCTGTATGTTTGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.155 | 0.039 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCAAACATACAGAGGACAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.157 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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