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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-08 08:42:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT34P02, TM0146.
AP004969.1:14048-14067
CGATGGAGTTGGTGGTGGTGGTGGAGGTAG14048ATGTTACCTGATGGCGACGGTGGTCGTGGTAGTAGTAGTGAGCTGGTGGA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:3609108-3609127
CGATGGAGTTGGTGGTGGTGGTGGAGGTAG3609108ATGTTACCTGATGGCGACGGTGGTCGTGGTAGTAGTAGTGACCTGGTGGA
Niallia circulans strain FDAARGOS_783 chromosome, complete genome.
CP053989.1:1766286-1766305
GACAAACCGGATATTGCGATTCTTGATGTT1766286ATGTTACCTGATGGCGACGGATTTTCCCTTCTGTCTTCTATCAGACAGCT
Lysinibacillus parviboronicapiens strain VT1065 chromosome, complete genome.
CP073713.1:4617157-4617176
GATAAGCCGGATATAGCAATTCTTGATGTC4617157ATGTTACCTGATGGCGACGGATTTTCACTTTTGTCATCCATCAGACAATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGTTACCTGATGGCGACGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGTTACCTGATGGCGACGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.092 | 0.083 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGTTACCTGATGGCGACGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.108 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCGTCGCCATCAGGTAACAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.108 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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