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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 07:41:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

39RDBRT_UP_048_F07_22JUL2004_053 Brassica rapa 39RDBRT Brassica rapa cDNA 5', mRNA sequence.
CX272976.1:11-30
GATATCACAA11CAACTCTAACGAACGAGAGCGAACAGTGAAAAAAGGAGAAGAAGAAGAAG
Marasmius oreades strain 43B chromosome 5.
CP097439.1:868305-868324
CGCGTTCGCAGAAGAGTTGATCGCGTATTG868305GCTCTCGTTCGTTAGAGTTGGTGATCCGAACAAGTTCAAGTTGGCCAGAT
Marasmius oreades strain 43A chromosome 5.
CP097450.1:830972-830991
CGCGTTCGCAGAAGAGTTGATCGCGTATTG830972GCTCTCGTTCGTTAGAGTTGGTGATCCGAACAAGTTCAAGTTGGCCAGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAACTCTAACGAACGAGAGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAACTCTAACGAACGAGAGC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.352 | 0.343 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAACTCTAACGAACGAGAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.439 | 0.088 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTCTCGTTCGTTAGAGTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.440 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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