GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-22 04:27:44, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

METAQ17TF JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence.
EY476332.1:863-886
TTTTGTATATATCCCATGAGCCAACTAGTT863CAAGAGGTCCAATTCCACCGCCCAATT
Medicago truncatula chromosome 8 clone mth2-20h6, complete sequence.
AC136953.17:24065-24088
TTTTGTATATATCCCATGAGCCAACTAGTT24065CAAGAGGTCCAATTCCACCGCCCAATTGGGAGGTCCCAATTTAAAGCTAGAACA
Medicago truncatula clone JCVI-FLMt-2M15 unknown mRNA.
BT136473.1:863-886
TTTTGTATATATCCCATGAGCCAACTAGTT863CAAGAGGTCCAATTCCACCGCCCAATT
M.truncatula ENOD16 gene.
X99466.1:1118-1141
TTTTGTATATATCCCATGAGCCAACTAGTT1118CAAGAGGTCCAATTCCACCGCCCAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAAGAGGTCCAATTCCACCGCCCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAAGAGGTCCAATTCCACCGCCCA | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.166 | 0.158 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAGAGGTCCAATTCCACCGCCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.183 | 0.017 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGGCGGTGGAATTGGACCTCTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.183 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).