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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-04 03:30:15, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea DNA, clone: 8iHA03P03, cultivar: YI-0311.
DE998525.1:479-501
AGTAATTTGTTCACTTATATTGACACTAGT479CACCAGTCAAGAAACAACAATTGTCAATCAATTTGTTTGAAGACTTTTCTATA
Arachis hypogaea DNA, clone: SATE0706.
DH968310.1:368-390
AGTAATTTGTTCACTTATATTGACACTAGT368CACCAGTCAAGAAACAACAATTGTCAATCAATTTGTTTGAAGACTTTTCTATA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A04.
CP030986.1:116769713-116769735
AGTAATTTGTTCACTTATATTGACACTAGT116769713CACCAGTCAAGAAACAACAATTGTCAATCAATTTGTTTGAAGACTTTTCTATA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACCAGTCAAGAAACAACAATTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACCAGTCAAGAAACAACAATTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.135 | 0.126 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACCAGTCAAGAAACAACAATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.152 | 0.017 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATTGTTGTTTCTTGACTGGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.152 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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