GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-07 05:32:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus DNA, clone:LjT57o11_not.
AG263450.1:348-368
AATCTGAAAATCCATTTAAGATTTTATTAT348CAGCATGCGCATGTTAAGTATATTTCATTATCTACCAAATGTTGTTTTTTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:1192708-1192728
AATCTGAAAATCCATTTAAGATTTTATTAT1192708CAGCATGCGCATGTTAAGTATATTTCATTATCTACCAAATGTTGTTTTTTT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjB23G22, BM1714.
AP010555.1:8500-8520
AAAAAAACAACATTTGGTAGATAATGAAAT8500ATACTTAACATGCGCATGCTGATAATAAAATCTTAAATGGATTTTCAGATT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjB02L14, BM1999.
AP010556.1:41193-41213
AAAAAAACAACATTTGGTAGATAATGAAAT41193ATACTTAACATGCGCATGCTGATAATAAAATCTTAAATGGATTTTCAGATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAGCATGCGCATGTTAAGTAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAGCATGCGCATGTTAAGTAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.112 | 0.104 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGCATGCGCATGTTAAGTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.146 | 0.033 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATACTTAACATGCGCATGCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.147 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).