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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 15:47:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Galeopsis tetrahit genome assembly, chromosome: 6.
OY776124.1:9695942-9695961
AAAAGGGGTTCGAATCTTTGTATTCCTCTG9695942CCACTGTCACTACCACTTGCTTATCTTCATCAGCATCACTCACAATCTCA
Megachile leachella genome assembly, chromosome: 12.
OY756258.1:2668447-2668466
ATACTTAAATTCGTAATATTTGTTCCTAAA2668447CCACTGTCACTACCACTTGCATTTAATAATTGAAATAAACTATTTAAATT
Mobula hypostoma genome assembly, chromosome: 18.
OY992610.1:53124863-53124882
AAGCAAAAGATTTATAACTAATACTGTTAG53124863GCAAGTGGTAGTGACAGTGGTGATGACTGGTAATTTATTTTTGGACATGG
TSA: Cannabis sativa PK15972.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449819.1:1028-1047
GATAAGGTCATTAGTAGCAATTCTACTATT1028GCAAGTGGTAGTGACAGTGGTGATAATTCAGAGGAGGGTTTGAAAAAAGA
Megachile willughbiella genome assembly, chromosome: 11.
OX243804.1:12991698-12991717
AATTTAAATAATTTATTTTAATTATTAAAT12991698GCAAGTGGTAGTGACAGTGGGTTATGAACAAATATGGCGCATTTAAGAAT
Metalampra italica genome assembly, chromosome: 26.
OX452996.1:138160-138179
GCGGTCGACTGTACACTACAGGGGCGATGT138160GCAAGTGGTAGTGACAGTGGGCTCGCGAGGACGTTTTGTACGTGTGTGTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCACTGTCACTACCACTTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCACTGTCACTACCACTTGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.093 | 0.085 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCACTGTCACTACCACTTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.124 | 0.030 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAAGTGGTAGTGACAGTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.126 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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