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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-08 17:18:10, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:41457739-41457758
CCTTGTCGTCCCTGCCATGCCTGTTTCTTT41457739CCCGATTAGACGGTTGTGTAGCATTTTCTGCAATAAAGGGTTGATGTTCA
Thysanoteuthis rhombus genome assembly, chromosome: 3.
OY735200.1:40950628-40950647
TTTTTCTTTTCTGGACAGCAATTCATACTG40950628CCCGATTAGACGGTTGTGTAGTTTAGTTAACAAAATTGACCTTACTGTAT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjT05I20, TM0245.
AP006383.1:59525-59544
TGAACATCAACCCTTTATTGCAGAAAATGC59525TACACAACCGTCTAATCGGGAAAGAAACAGGCATGGCAGGGACGACAAGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCCGATTAGACGGTTGTGTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCCGATTAGACGGTTGTGTA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.088 | 0.079 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCGATTAGACGGTTGTGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.102 | 0.014 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACACAACCGTCTAATCGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.103 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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