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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 03:11:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 4, clone: LjT11O06, TM0194.
AP006108.1:63849-63868
AAAATTTCTCCTCTCACTCTCATATAAAAA63849CCCTCCCTCTCACTAGATACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:48758631-48758650
TTTTATATATATATAATATATATTGGGAGA48758631GTATCTAGTGAGAGGGAGGGTTCTTATGTGAGAGTGAGAGAATTAATTTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:81418742-81418761
AAACACAAAACATAATAAATATATGAGGGA81418742GTATCTAGTGAGAGGGAGGGTTTTTATGTGAGAGTGAGAGGAATAATTTA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 4, complete sequence.
AP022632.1:16040698-16040717
ATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG16040698GTATCTAGTGAGAGGGAGGGTTTTTATATGAGAGTGAGAGGAGAAATTTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 4, complete sequence.
AP022632.1:16183568-16183587
TATATATATATATATATATATATAGAGGGG16183568GTATCTAGTGAGAGGGAGGGTTTTTATATGAGAGTGAGAGGAGCAATTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCCTCCCTCTCACTAGATAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCCTCCCTCTCACTAGATAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.102 | 0.093 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCTCCCTCTCACTAGATAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.127 | 0.024 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTATCTAGTGAGAGGGAGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.129 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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