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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-18 11:41:30, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 4, clone: LjB09H01, BM1084.
AP007795.2:13514-13533
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTT13514CCTGATTAACGAACGCTATCAATTTGTCAAGTTTTTTCTTTTCTTTTCTG
Lotus japonicus GAGA-binding transcriptional activator (BBR/BPC3) gene, complete cds.
FJ982320.1:242-261
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTT242CCTGATTAACGAACGCTATCAATTTGTCAAGTTTTTTCTTTTCTTTTCTG
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 4, clone: LjT39E03, TM0266.
AP006392.1:38400-38419
CAGAAAAGAAAAGAAAAAACTTGACAAATT38400GATAGCGTTCGTTAATCAGGAAAATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 4, complete sequence.
AP022632.1:79551231-79551250
CAGAAAAGAAAAGAAAAAACTTGACAAATT79551231GATAGCGTTCGTTAATCAGGAAAATAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTAAAGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTGATTAACGAACGCTATC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTGATTAACGAACGCTATC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.098 | 0.089 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTGATTAACGAACGCTATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.113 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATAGCGTTCGTTAATCAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.115 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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