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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-04 10:23:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lathyrus sativus genome assembly, chromosome: 2.
OZ012736.1:455698012-455698033
AGCTTCAGCAGATTGACCAGGTGTCCCTCC455698012CCTGTTTGGGACTTTGCTATCATATAATCAACATAGACTTCAATCTCGTGAT
Lathyrus aphaca genome assembly, chromosome: 7.
OZ014525.1:176090858-176090879
AACTTTGCTAGGTTGACTATATGCTCTTCT176090858CCTGTTTGGGACTTTGCTATCATATCATCAACATAGACCTCAATCTCATGAT
MERIP0001K18.B MeriP Pisum sativum Shoot apical meristem ESTs Pisum sativum cDNA clone MERIP0001K18.B, mRNA sequence.
FG529281.1:357-378
TGACTCATCATGACATCGATTGCTATGACA357TGATAGCAAAGTCCCAAACAGGAGTGGGGCATCGGGTGGAGATAATTCAAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTGTTTGGGACTTTGCTATCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTGTTTGGGACTTTGCTATCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.103 | 0.094 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTGTTTGGGACTTTGCTATCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.192 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGATAGCAAAGTCCCAAACAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.193 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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