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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-09 11:35:23, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Trifolium pratense DNA, clone:RC0574f.ab1.
DE245666.1:172-191
AAATATATTACAAGGTTTTTATTATTTTTT172CCTTAACCATTGCCATTGTAATGAGAGATAAGAATTTCAATTTGTGTCTC
Schizosaccharomyces japonicus strain yFS275 chromosome 2.
CP133360.1:5634638-5634657
AGAACCGCGGAACCGTCTTGCCAACGGTGG5634638TACAATGGCAATGGTTAAGGGAACACGAGCAACAATGAGTGCCTTATGAA
Schizosaccharomyces japonicus genome assembly, chromosome: 2.
OY101112.1:4262279-4262298
AGAACCGCGGAACCGTCTTGCCAACGGTGG4262279TACAATGGCAATGGTTAAGGGAACACGAGCAACAATGAGTGCCTTATGAA
Harmothoe impar genome assembly, chromosome: 17.
OX381720.1:64425334-64425353
TCATATAAAACCCCGTATAACCCTAGCCCC64425334TACAATGGCAATGGTTAAGGGCTACGTTACGTCTACGTTTTATAAGCTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTTAACCATTGCCATTGTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTTAACCATTGCCATTGTA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.103 | 0.095 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTTAACCATTGCCATTGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.119 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACAATGGCAATGGTTAAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.121 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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