GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 08:15:04, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Globicephala melas genome assembly, chromosome: 6.
OY734045.1:22931109-22931128
CTCACTGACAAATGTCCAGGCTACCATGAC22931109CCTTGCAAGCTACAGGCTTTGGGAATACTGAGCCCAGTGGAGCCCAATGC
KS16052A10 KS16 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD074296.1:408-427
AAGCCCATTTACAAACAAAACAAAACCAAA408CCTTGCAAGCTACAGGCTTTTTCTTTGTTACCTTTCTTTTTGTTCTCTCT
KS17037E01 KS17 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD078970.1:45-64
AAGCCCATTTACAAACAAAACAAAACCAAA45CCTTGCAAGCTACAGGCTTTTTCTTTGTTACCTTTCTTTTTGTTCTCTCT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 1, sequence.
AP026696.1:13353091-13353110
AAGCCCATTTACAAACAAAACAAAACCAAA13353091CCTTGCAAGCTACAGGCTTTTTCTTTGTTACCTTTCTTTTTGTTCTCTCT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 1.
CP124731.1:13818690-13818709
AAGCCCATTTACAAACAAAACAAAACCAAA13818690CCTTGCAAGCTACAGGCTTTTTCTTTGTTACCTTTCTTTTTGTTCTCTCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CCTTGCAAGCTACAGGCTTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CCTTGCAAGCTACAGGCTTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.274 | 0.265 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTTGCAAGCTACAGGCTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.292 | 0.018 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAGCCTGTAGCTTGCAAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.292 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).