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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-26 10:09:00, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Vigna radiata VCAX1 mRNA for Ca2+/H+ exchanger, complete cds.
AB012932.1:1875-1894
TTGTTTCTACTATTACTACTACTCTATGTA1875CGACCTTTTGCATGTGACTCCTTATGAGTTTTCGAAGTTATATTCATATG
Vigna angularis var. angularis DNA, chromosome 4, almost complete sequence, cultivar: Shumari.
AP015037.1:17202994-17203013
TTCTTACTACTACTACTACTACTCTATGTA17202994CGACCTTTTGCATGTGACTCCTTATGAGTTTTCAAAGTTATATTCATATA
Brachypterus glaber genome assembly, chromosome: 3.
OY294046.1:15718359-15718378
GTTAGAATATGCGAAAATTGGTACTTACTA15718359CGACCTTTTGCATGTGACTCTCTCTCATATCATGCGAATGCCCTTTTCAG
Vigna angularis mRNA, clone: VES09L01.
HX945742.1:47-66
TATATGAATATAACTTTGAAAACTCATAAG47GAGTCACATGCAAAAGGTCGTACATAGAGTAGTAGTAGTAGTAGTAAGAA
Vigna angularis mRNA, clone: VES10B17.
HX945897.1:47-66
TATATGAATATAACTTTGAAAACTCATAAG47GAGTCACATGCAAAAGGTCGTACATAGAGTAGTAGTAGTAGTAGTAAGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGACCTTTTGCATGTGACTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGACCTTTTGCATGTGACTC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.118 | 0.110 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGACCTTTTGCATGTGACTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.299 | 0.180 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGTCACATGCAAAAGGTCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.300 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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