GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 07:37:01, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica oleracea var. botrytis putative G-protein-coupled transmembrane receptor mRNA, complete cds.
AF227978.1:1171-1190
TACATCCATCACAGATTCACCTAGTTTCTT1171CGGAGAACTTCGAAGATGTCGGAGCTAGAGCTGTTCATGCTCGTTCCACC
Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C3.
LR031872.1:9307874-9307893
TACATCCATCACAGATTCACCTAGTTTCTT9307874CGGAGAACTTCGAAGATGTCGGAGCTAGAGCTGTTCATGCTCGTTCCACC
Xestia xanthographa genome assembly, chromosome: 19.
LR990660.1:2715747-2715766
TCGTTTGGTCAAACTTTATTAAAATCGATC2715747CGGAGAACTTCGAAGATGTCGCAGACTGGTAAGGTCTCTGAAGTATTTAG
BONJR01TR BO_1.6_2_KB_tot Brassica oleracea genomic clone BONJR01, genomic survey sequence.
BZ442119.1:519-538
GGTGGAACGAGCATGAACAGCTCTAGCTCC519GACATCTTCGAAGTTCTCCGAAGAAACTAGGTGAATCTGTGATGGATGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGGAGAACTTCGAAGATGTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGGAGAACTTCGAAGATGTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.116 | 0.107 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGGAGAACTTCGAAGATGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.140 | 0.024 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACATCTTCGAAGTTCTCCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.141 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).