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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-15 19:42:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GM700013A20D10 Gm-r1070 Glycine max cDNA clone Gm-r1070-5156 3', mRNA sequence.
BE820963.1:359-378
TAAACACACACATGTCATGTTAATTGGGTT359CGTATCTTTGGCTTTGCACAGAACGTGCAACATGAGGAAACAAGAGAAGC
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 4.
CP126429.1:6206238-6206257
TAAACACACACATGTCATGTTAATTGGGTT6206238CGTATCTTTGGCTTTGCACAGAACGTGCAACATGAGGAAACAAGAGAAGC
Miltochrista miniata genome assembly, chromosome: 13.
OW121760.1:7187620-7187639
AATTAAACCTGGAAATTACTTCGTATTTTT7187620CGTATCTTTGGCTTTGCACAGTAACGATATTGCCAATGAAAATTCACTTC
sh82f05.y1 Gm-c1016 Glycine max cDNA clone GENOME SYSTEMS CLONE ID: Gm-c1016-6682 5', mRNA sequence.
AW432763.1:98-117
GCTTCTCTTGTTTCCTCATGTTGCACGTTC98TGTGCAAAGCCAAAGATACGAACCCAATTAACATGACATGTGTGTGTTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CGTATCTTTGGCTTTGCACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CGTATCTTTGGCTTTGCACA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.097 | 0.089 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGTATCTTTGGCTTTGCACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.118 | 0.021 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTGCAAAGCCAAAGATACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.119 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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