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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-04 03:33:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Citrus reshni microsatellite DNA, locus mCrCIR02B11.
FR692358.1:329-348
CTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGT329CTCACACCCTATTTACTTTGTTGT
Citrus sinensis genome assembly, chromosome: 9.
OY754326.1:4154777-4154796
AATAACACCAACTTCTCTTTTGGGGTACAA4154777CAAAGTAAATAGGGTGTGAGAGCTTCTCTCTCTCTCTAAGCAAACACAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCACACCCTATTTACTTTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCACACCCTATTTACTTTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.100 | 0.091 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCACACCCTATTTACTTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.115 | 0.015 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAAGTAAATAGGGTGTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.115 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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