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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 07:08:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus cDNA clone:MWM113g04_r, 5' end.
AV415574.1:79-98
CCTCCCTTCCTCCAAAACTCATGGAATCCT79CTCCCATTGAACGCCTTGACTTTGGGAAGATGGGATATGGGTGCAAGCAT
Lotus japonicus cDNA clone:MWM177d09_r, 5' end.
AV420101.1:92-111
CCTCCCTTCCTCCAAAACTCATGGAATCCT92CTCCCATTGAACGCCTTGACTTTGGGAAGATGGGATATGGGTGCAAGCAT
Lotus japonicus cDNA clone:MWM078f12_r, 5' end.
AV427258.1:109-128
CCTCCCTTCCTCCAAAACTCATGGAATCCT109CTCCCATTGAACGCCTTGACTTTGGGAAGATGGGATATGGGTGCAAGCAT
Lotus japonicus mRNA, clone: MR031d12_r, 5' end sequence.
DC599121.1:96-115
CCTCCCTTCCTCCAAAACTCATGGAATCCT96CTCCCATTGAACGCCTTGACTTTGGGAAGATGGGATATGGGTGCAAGCAT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjT15B19, TM0756.
AP010076.1:9318-9337
AAACACACACCCATATCCCATCTTCCCAAA9318GTCAAGGCGTTCAATGGGAGAGGATTCCATGAGTTTTGGAGGAAGGGAGG
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:62366705-62366724
AAACACACACCCATATCCCATCTTCCCAAA62366705GTCAAGGCGTTCAATGGGAGAGGATTCCATGAGTTTTGGAGGAAGGGAGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTCCCATTGAACGCCTTGAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTCCCATTGAACGCCTTGAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.157 | 0.148 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCCCATTGAACGCCTTGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.173 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCAAGGCGTTCAATGGGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.174 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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