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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-05 07:40:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Peromyscus eremicus genome assembly, chromosome: 1.
OX460394.1:109504420-109504439
GAAAATCAGCATGGTGGTTTCTCAGAACAC109504420TGGGAATCAACCTGCACAAGACCCAGCTATATCCATTTTGGGCATATACC
Peromyscus eremicus genome assembly, chromosome: 1.
OX460466.1:109625692-109625711
GAAAATCAGCATGGTGGTTTCTCAGAACAC109625692TGGGAATCAACCTGCACAAGACCCAGCTATATCCATTTTGGGCATATACC
Chrysotoxum festivum genome assembly, chromosome: 3.
OZ007556.1:146263130-146263149
TCCAGCTACATATGTATTCGCAAGAACCTA146263130TGGGAATCAACCTGCACAAGGAAAATGTGAAGTGAATGACCTACTTACAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CTTGTGCAGGTTGATTCCCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CTTGTGCAGGTTGATTCCCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.091 | 0.082 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGTGCAGGTTGATTCCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.104 | 0.013 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGGAATCAACCTGCACAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.106 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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