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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-19 13:24:23, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KR 1020150047857-A/1: Primer Set Useful for Selecting Pathogen Resistance Pepper.
DI494683.1:1202-1225
AGGTTGCTGGTTATGGGATAGCTTGAAATG1202CCATATCATGAATTCTTGTCCTTCATTGTTATCATAATAATCTCTACTATTGTT
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig21263, mRNA sequence.
JW071507.1:444-467
AGGTTGCTGGTTATGGGATAGCTTGAAATG444CCATATCATGAATTCTTGTCCTTCATTGTTATCATAATAATCTCTACTATTGTT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 2, sequence.
AP026697.1:65142001-65142024
AGGTTGCTGGTTATGGGATAGCTTGAAATG65142001CCATATCATGAATTCTTGTCCTTCATTGTTATCATAATAATCTCTACTATTGTT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 2.
CP124730.1:65371022-65371045
AGGTTGCTGGTTATGGGATAGCTTGAAATG65371022CCATATCATGAATTCTTGTCCTTCATTGTTATCATAATAATCTCTACTATTGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAAGGACAAGAATTCATGATATGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAAGGACAAGAATTCATGATATGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.095 | 0.086 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAGGACAAGAATTCATGATATGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.135 | 0.040 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCATATCATGAATTCTTGTCCTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.138 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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