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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-18 09:25:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Musa acuminata AAA Group Unigene9044_B1 mRNA sequence.
JV377284.1:815-834
TGTTTCGAGAAACTTCATTTGCAAATTTGA815GAATGCGGCAACAAAGGTATTTTGCTAAAATCTGGCACCTTTTGTCTCTT
TSA: Musa acuminata AAA Group Unigene82971_NK1 mRNA sequence.
JV443148.1:145-164
TGTTTCGAGAAACTTCATTTGCAAATTTGA145GAATGCGGCAACAAAGGTATTTTGCTAAAATCTGGCACCTTTTGTCTCTT
Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 3.
CP126372.1:41781534-41781553
AAGAGACAAAAGGTGCCAGATTTTAGCAAA41781534ATACCTTTGTTGCCGCATTCTCAAATTTGCAAATGAAGTTTCTCGAAACA
Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 14.
CP126383.1:41745219-41745238
AAGAGACAAAAGGTGCCAGATTTTAGCAAA41745219ATACCTTTGTTGCCGCATTCTCAAATTTGCAAATGAAGTTTCTCGAAACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GAATGCGGCAACAAAGGTAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GAATGCGGCAACAAAGGTAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.122 | 0.113 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATGCGGCAACAAAGGTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.141 | 0.019 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATACCTTTGTTGCCGCATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.143 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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