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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-07 11:35:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Dolomedes plantarius genome assembly, chromosome: 7.
OU015496.1:79120025-79120043
GAACGGATTTAAATTTTTGTCGGTCTGTAT79120025GACCAATAAGCGTTGAACCGTACTAATTATATCTGTCAGTCTGCATGCA
Spinacia oleracea partial pseudogene for bZIP protein, 782 bp.
AJ223623.1:751-769
ATTTGTATATTATTTTTAAGTTGTGAGACA751GGTTCAACGCTTATTGGTCGTATATATTATTT
Halarcobacter ebronensis strain LMG 27922 chromosome, complete genome.
CP053836.1:2628297-2628315
CTTGATGTAAAAGCAGCAGTAGATTTAAAT2628297GGTTCAACGCTTATTGGTCCAAATTGTCCTGGTATTATAACACCAAATC
Paenibacillus sp. R14(2021) chromosome, complete genome.
CP080269.1:989019-989037
ACGCGAAGGTGCAGGCGAACGTGCTGAAGC989019GGTTCAACGCTTATTGGTCCTCGCATATCGCCGGCAGCCAGCTGCTCCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GACCAATAAGCGTTGAACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GACCAATAAGCGTTGAACC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.107 | 0.099 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACCAATAAGCGTTGAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.124 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTTCAACGCTTATTGGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.126 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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