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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 07:17:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjT32P24, TM0120.
AP006081.1:122739-122758
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGCATAAA122739GATAATTGTGGCGTGAATTTTTAATAAAAAGAAAAATATGATGGTAAGAG
Gonocerus acuteangulatus genome assembly, chromosome: 4.
OX328126.1:74426422-74426441
AGGGTGTATTTGTGATTTAAAAGAAGATAT74426422GATAATTGTGGCGTGAATTTATATTGCAACAAAAAAAAAAAAAATCTTTT
Maratus speciosus genome assembly, chromosome: 12.
OZ010799.1:272657559-272657578
GACAGTTGTTGTAACAATGTTAAAATTTTA272657559GATAATTGTGGCGTGAATTTATTAGCAGTTCATTTGAATTTGTTTCGTAC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:76926419-76926438
CTCTTACCATCATATTTTTCTTTTTATTAA76926419AAATTCACGCCACAATTATCTTTATGCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GATAATTGTGGCGTGAATTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GATAATTGTGGCGTGAATTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.094 | 0.086 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATAATTGTGGCGTGAATTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.109 | 0.015 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAATTCACGCCACAATTATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.110 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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