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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-06 04:45:40, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Cajanus cajan cultivar Asha contig13974.Asha mRNA sequence.
EZ661838.1:346-365
TCGCAGTGGGAGGGCGGGGCCCACTGAAGG346ACTCAACGGTGCTACTCATCCCACTCGATGTGGGCCTCTGAGGGTTGTTA
Heterobilharzia americana genome assembly, chromosome: 1.
OX104103.1:73673143-73673162
TCCTACTTATGTTCTCCTTTTATCCTATTG73673143ACTCAACGGTGCTACTCATCTGATTGATTTCTTTGTGCATTGAGTAGTTA
Heterobilharzia americana genome assembly, chromosome: 1.
OX104127.1:74942603-74942622
TCCTACTTATGTTCTCCTTTTATCCTATTG74942603ACTCAACGGTGCTACTCATCTGATTGATTTCTTTGTGCATTGAGTAGTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GATGAGTAGCACCGTTGAGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GATGAGTAGCACCGTTGAGT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.088 | 0.080 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATGAGTAGCACCGTTGAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.103 | 0.015 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTCAACGGTGCTACTCATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.106 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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