GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 18:23:56, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 4, complete sequence.
AP022632.1:47030531-47030550
CAGACCTTCTACGCTATATTCCTAATCATA47030531GCTAGTGTTCCACATGAGACAAACTTTTTTTTCTTATCTTACAAAAAGTG
Aphrophora alni genome assembly, chromosome: 1.
OY740766.1:75549469-75549488
ATTGTATGCGTCAGACAACCAATTTGAAGC75549469GCTAGTGTTCCACATGAGACTGGTAAAAATAATAGTAAGCTCTAATTTTA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 4, clone: LjT22I23, TM0281b.
AP006400.1:14014-14033
CACTTTTTGTAAGATAAGAAAAAAAAGTTT14014GTCTCATGTGGAACACTAGCTATGATTAGGAATATAGCGTAGAAGGTCTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTAGTGTTCCACATGAGAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTAGTGTTCCACATGAGAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.092 | 0.083 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTAGTGTTCCACATGAGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.108 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCTCATGTGGAACACTAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.109 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).