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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-19 06:01:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Phalacrocorax aristotelis genome assembly, chromosome: 1.
OX451222.1:132697545-132697564
GAGTGGCACTGTGTGGACACACGACCCTTA132697545GCTCAGCAACCACAGTACCATGTTCTGCTTTCTTCCAAGGGCTAGAAGAG
Acomys russatus genome assembly, chromosome: 29.
LR877240.1:34600711-34600730
TTCATGTTTGATAGTCACCTACCCAGACAA34600711TGGTACTGTGGTTGCTGAGCTTTATAAGGGGTAATCAGGAGACTTTGGGG
Phalacrocorax carbo genome assembly, chromosome: 1.
OY997601.1:86113385-86113404
CTCTTCTAGCCCTTGGAAGAAAGCAGAACA86113385TGGTACTGTGGTTGCTGAGCTAAGGGTCATGTGTCCACACAGTGCCACTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCTCAGCAACCACAGTACCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCTCAGCAACCACAGTACCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.114 | 0.105 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTCAGCAACCACAGTACCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.146 | 0.033 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGTACTGTGGTTGCTGAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.148 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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