GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 04:42:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Pyrus communis mRNA, contig: lc34061.
FX641958.1:157-176
ATTGTCCTTTAATTGTCACATTTTTGTATG157GGAAATGCAGGGTTGACAGGATTGATCTCTTTAAACGTATCAAATTCTCG
Pan troglodytes clone CH251-514B7, WORKING DRAFT SEQUENCE.
AC280488.1:156664-156683
TTCCCTGCCCACCCAGGCAGCTGTCCCAAG156664GGAAATGCAGGGTTGACAGGGCTAGCCTGAAGGCACATCGCCCTCTCTCA
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 17.
CP141926.1:8048832-8048851
CGAGAATTTGATACGTTTAAAGAGATCAAT8048832CCTGTCAACCCTGCATTTCCCATAGAAAAGTGTGACAATTAAAAGATAAT
Malus x robusta genome assembly, chromosome: 11.
OY720335.1:7850678-7850697
CGAGAATTTGATACGTTTAAAGAGATCAAT7850678CCTGTCAACCCTGCATTTCCCATAGAAAAGTGTGACAATTAAAAGATAAT
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 11.
OY757078.1:5989561-5989580
CGAGAATTTGATACGTTTAAAGAGATCAAT5989561CCTGTCAACCCTGCATTTCCCATACAAAAATGTGACAATTAAACGATAAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGAAATGCAGGGTTGACAGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGAAATGCAGGGTTGACAGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.095 | 0.086 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAAATGCAGGGTTGACAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.110 | 0.015 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTGTCAACCCTGCATTTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.112 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).