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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-19 03:10:43, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 4.
CP123879.1:2436860-2436879
AAGCAACCAAAATGATGGTTATTATAATTT2436860GGATCAAATTATGGCGGTGACTTCAGAACCTTCAAGTCTTATAGGCCCTC
Brassica napus genome assembly, chromosome: A09.
HG994363.1:2358669-2358688
AAGCAACCAAAATGATGGTTATTATAATTT2358669GGATCAAATTATGGCGGTGACTTCAGAACCTTCAAGTCTTATAGGCCCTC
Brassica rapa genome, scaffold: A09.
LR031568.1:2107021-2107040
AAGCAACCAAAATGATGGTTATTATAATTT2107021GGATCAAATTATGGCGGTGACTTCAGAACCTTCAAGTCTTATAGGCCCTC
Brassica rapa genome assembly, chromosome: A09.
LS974625.2:2332976-2332995
AAGCAACCAAAATGATGGTTATTATAATTT2332976GGATCAAATTATGGCGGTGACTTCAGAACCTTCAAGTCTTATAGGCCCTC
Brassica rapa subsp. pekinensis cultivar Inbred line 'Chiifu' chromosome Cytogenetic chromosome 1 clone KBrH097M21, complete sequence.
AC155348.1:70530-70549
GAGGGCCTATAAGACTTGAAGGTTCTGAAG70530TCACCGCCATAATTTGATCCAAATTATAATAACCATCATTTTGGTTGCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGATCAAATTATGGCGGTGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGATCAAATTATGGCGGTGA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.108 | 0.099 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATCAAATTATGGCGGTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.126 | 0.018 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCACCGCCATAATTTGATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.127 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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