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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 18:28:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Sequence 13287 from Patent WO2016022021.
LP658852.1:1062-1081
CTCTACCCTTTGCATCATTTGGAAACAATG1062GGGACATATTGCTGTACAACCACAAAAATATTCATGTCATTCACCAAGGC
Sequence 13295 from Patent WO2016022021.
LP658860.1:9029762-9029781
CTCTACCCTTTGCATCATTTGGAAACAATG9029762GGGACATATTGCTGTACAACCACAAAAATATTCATGTCATTCACCAAGGC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjT14O07, TM0013.
AP004481.1:14267-14286
TTGAATTTTTCTAATGACATGTTTTAGCGG14267GGGACATATTGCTGTACAACATCAATATTAATTGACACAGTGACAGAGTA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:52508360-52508379
TTGAATTTTTCTAATGACATGTTTTAGCGG52508360GGGACATATTGCTGTACAACATCAATATTAATTGACACAGTGACAGAGTA
Lipophrys pholis genome assembly, chromosome: 9.
OY726541.1:19847382-19847401
GATAAAGGTCTTACGTAAGGCCCTGCCAGT19847382GTTGTACAGCAATATGTCCCTCAGCACGGGGTAGAGGATTGTTAGTGGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGGACATATTGCTGTACAAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGGACATATTGCTGTACAAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.172 | 0.164 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGACATATTGCTGTACAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.195 | 0.022 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTGTACAGCAATATGTCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.195 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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