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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-14 21:50:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

GF_Ba045G22.R GF_Ba Glycine falcata genomic 3', genomic survey sequence.
HR146778.1:128-147
CATCTTCTCTTTCATTAAAGAAAATTCTTT128GGTCCTTCAAAAGAGTCCCAAATAACAATTTGTAACTTTCACACAAACAA
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 8.
CP126433.1:7590233-7590252
CATCTGCTCTTTCATAAAAGAAAATTCTTT7590233GGTCCTTCAAAAGAGTCCCAAATAACAATTTGTATCATTCACACAAACAA
Callimorpha dominula genome assembly, chromosome: Z.
OX456990.1:1650188-1650207
CATTAAAAAAGCAGCTCCACTTTACCTCCA1650188GGTCCTTCAAAAGAGTCCCACAAGTCTGTGTGCTATCCCACGCTGTTTCT
sad10e02.y1 Gm-c1073 Glycine max cDNA clone GENOME SYSTEMS CLONE ID: Gm-c1073-2139 5', mRNA sequence.
BG511750.1:196-215
TTGTTTGTGTGAATGATACAAATTGTTATT196TGGGACTCTTTTGAAGGACCAAAGAATTTTCTTTTAAAAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGTCCTTCAAAAGAGTCCCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGTCCTTCAAAAGAGTCCCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.146 | 0.137 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTCCTTCAAAAGAGTCCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.175 | 0.030 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGGACTCTTTTGAAGGACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.176 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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