GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-04 09:48:34, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Trifolium repens mRNA, clone: WCC41h22_060, unspecified EST.
FY468633.1:456-475
GGACTGAGTAAGGAAGATGTGAAGATTTCT456GTTGAACAGAACACACTTACTATTAAAGGTGAAGGCGCTAAAGAAAGTGA
Papaver somniferum cultivar Roxanne chromosome 3.
CP048215.1:243210895-243210914
CCATCTTCCTTCTCTCCTTCTCCTTTGATT243210895GTAAGTGTGTTCTGTTCAACAGAGACTTTAACATTCTCCTTGCCAAGTCC
Papaver somniferum cultivar Roxanne chromosome 7.
CP048219.1:77429512-77429531
CCGTCTTCTTTCTCTCCTTCTCCTTTGATT77429512GTAAGTGTGTTCTGTTCAACAGAGACTTTGACATTCTCCTTACCAAGTCC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Occ.
CP125842.1:7544682-7544701
TCACTTTCTTTAGCACCTTCACCTTTAATA7544682GTAAGTGTGTTCTGTTCAACAGAAATCTTCACATCTTCCTTACTCAGTCC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Pall.
CP125843.1:8625077-8625096
TCACTTTCTTTAGCACCTTCACCTTTGATA8625077GTAAGTGTGTTCTGTTCAACAGAGATCTTCACATCTTCCTTACTCAGTCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTTGAACAGAACACACTTAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTTGAACAGAACACACTTAC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.405 | 0.396 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTGAACAGAACACACTTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.501 | 0.096 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTAAGTGTGTTCTGTTCAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.504 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).