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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 08:16:24, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

AT_SBa0001M08.f AT__SBa Amborella trichopoda genomic clone AT_SBa0001M08 5', genomic survey sequence.
HR617539.1:699-718
TGCTAGAGGAAGAGCCAGGGATTGTGGATA699TAACATGCTTGGTGAGCGAGATGTATATTTTTCCTGCCACTTAACCCAGC
AT_SBa0052C01.f AT__SBa Amborella trichopoda genomic clone AT_SBa0052C01 5', genomic survey sequence.
HR653444.1:701-720
TGCTAGAGGAAGAGCCAGGGATTGTGGATA701TAACATGCTTGGTGAGCGAGTTGTATATTTTTCCTGCCACTTAACCCAGC
Atr02b_72_H01_C011.g1 FGP Female Amborella trichopoda Amborella trichopoda cDNA clone 122Dhq_P02 5', mRNA sequence.
FD438566.1:183-202
GCTGGGTTAAGTGGCAGGAAAAATATACAA183CTCGCTCACCAAGCATGTTATATCCACAATCCCTGGCTCTTCCTCTAGCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TAACATGCTTGGTGAGCGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TAACATGCTTGGTGAGCGAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.167 | 0.158 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAACATGCTTGGTGAGCGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.252 | 0.085 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCGCTCACCAAGCATGTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.253 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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