GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-07 05:30:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Pyrus communis genome assembly, chromosome: 2.
OY757069.1:6376360-6376379
ATACAACTGAACTGTAGAGGGGCAGAATAG6376360TACAGCCAACTTACCACCTTTTTGGTGCTGCTTCTTCCAAACATAAAATA
Diplosoma virens genome assembly, chromosome: 1.
OY796880.1:48590908-48590927
ATCCCGGCAGTACAACAGCCAGTACAAATA48590908TACAGCCAACTTACCACCTTAAAATTAATTCAGTCTTAAAATGGCTCGTT
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 2.
OY757069.1:9416593-9416612
TGTTTTATGTTTGGAAGAAGCAGCACCAGA9416593AAGGTGGTAAGTTGGCTGTACTATTCTGCTCCTCTGCTTTCCAAGTTACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TACAGCCAACTTACCACCTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TACAGCCAACTTACCACCTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.094 | 0.085 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACAGCCAACTTACCACCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.109 | 0.015 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGGTGGTAAGTTGGCTGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.110 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).