GGGenome | Results

2025-03-21 11:44:43, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

N210666e MHAM Medicago truncatula/Glomus versiforme mixed EST library cDNA clone MHAM-2P11, mRNA sequence.
AW584590.1:217-238

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT217GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

EST486173 MHAM Medicago truncatula/Glomus versiforme mixed EST library cDNA clone pMHAM-15D7 5' end, mRNA sequence.
BG584413.1:147-168

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT147GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

MTNAL80TKM KVKC Medicago truncatula cDNA clone pKVKC-12G8, mRNA sequence.
BQ255419.1:223-244

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT223GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

s13dNF42B01MJ009_244282 Methyl Jasmonate-Elicited Root Cell Suspension Culture Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence.
CX529112.1:193-214

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT193GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

MHAM15C_B04_T3_029.seq MHAM2 Medicago truncatula/Glomus versiforme mixed EST library cDNA, mRNA sequence.
CX549288.1:151-172

CAATTTCCTCTTATGCNTGTCGTGTTTGAT151GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

METAN53TF JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence.
EY476093.1:223-244

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT223GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

TSA: Medicago sativa cultivar Chilean F0D_558 mRNA sequence.
JL867013.1:237-258

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT237GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATCCATGTTTACCATTTTGATCAAAACTTAG

Medicago truncatula MtAPY1;1 mRNA for apyrase, complete cds, ecotype: R108-1.
AB793274.1:151-172

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT151GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTATCATTTTGATCAGAACTTAG

Genomic sequence for Medicago truncatula, clone MTABa0052G10, complete sequence.
AC123593.1:76965-76986

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT76965GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

Medicago truncatula apyrase-like protein (APY1;1) mRNA, complete cds.
AY180377.1:205-226

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT205GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

Medicago truncatula clone JCVI-FLMt-18A8 unknown mRNA.
BT149149.1:223-244

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT223GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATTCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

Medicago arabica genome assembly, chromosome: 6.
OX326969.1:44293609-44293630

ACAATTTCCTCTTATGCTGTCGTGTTTGAT44293609GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATCCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

Trifolium dubium genome assembly, chromosome: 4.
OX638065.1:41341950-41341971

ACAATTTCCTCATACGCTGTCGTTATTGAT41341950GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATCCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAA

Trifolium dubium genome assembly, chromosome: 11.
OX638072.1:29006324-29006345

ACAATTTCCTCATACGCTGTCGTTATTGAT29006324GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTATCCATGTTTACCATTTTGATCAGAACTTAG

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.105 | 0.096 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACGGCTACCAGTGCTACCAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.292 | 0.187 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTGGTAGCACTGGTAGCCGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.301 | 0.009 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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