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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 21:49:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Glycine max DNA, BAC clone: GMJENa0126K11_R, 3'end, cultivar: ENREI.
LB078100.1:607-626
TTTCATCCCAACAGCTACCATTATAACCCC607TCAAGGCAACTGAATTGTCGATCCTTTTGTCCACTTATTGGGAGAACTCA
Hermetia illucens genome assembly, chromosome: 1.
LR899009.1:47722730-47722749
CGGCACAATAATTATGTATATGATTCCAAT47722730TCAAGGCAACTGAATTGTCGCTCATCCACAGAGCTTGTCTAGAATGAAGT
Myrrha octodecimguttata genome assembly, chromosome: 4.
OY294059.1:60735125-60735144
ACTCCGTATAGTATATAAATCAAAGAGACT60735125TCAAGGCAACTGAATTGTCGAATGTATTTGGGTTAGTCAAACAGTTATTA
GM830007A20E07 Gm-r1083 Glycine max cDNA clone Gm-r1083-2510 3', mRNA sequence.
BI969102.1:254-273
TGAGTTCTCCCAATAAGTGGACAAAAGGAT254CGACAATTCAGTTGCCTTGAGGGGTTATAATGGTAGCTGTTGGGATGAAA
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 12.
CP126437.1:14121728-14121747
TGAGTTCTCCCAATAAGTGGACAAAAGGAT14121728CGACAATTCAGTTGCCTTGAGGGGTTATAATGGTAGCTGTTGGGATGAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCAAGGCAACTGAATTGTCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCAAGGCAACTGAATTGTCG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.148 | 0.140 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAAGGCAACTGAATTGTCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.184 | 0.036 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGACAATTCAGTTGCCTTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.185 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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