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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-04 08:15:24, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Alisma plantago-aquatica genome assembly, chromosome: 2.
OY856410.1:312607346-312607365
TGACATGAAATGAAATTTTCTAAAAGTGAC312607346TCAAGGTTGGGTTTTGAATGTGACTGAAGCTTGTTGAAATTCCAATTTCC
Trifolium pratense DNA, clone:RC0475f.ab1.
DE245477.1:288-307
GAAGTTTTTTAAACAACAAAAGTTCTTAAA288CATTCAAAACCCAACCTTGATTACACACACACACACACACATAGAAGTGA
Orthosia gothica genome assembly, chromosome: 5.
OX459038.1:15261088-15261107
GTGCCGACTTTACTTGAACGGATATCATTA15261088CATTCAAAACCCAACCTTGATGAACCTTGCCTTACATCCGGTAATAAACT
Acrobasis repandana genome assembly, chromosome: 12.
OY756226.1:1193610-1193629
CCACAAAATCCTAAATACCACACTACCTTA1193610CATTCAAAACCCAACCTTGATTTGAATAGCATAGAGTTAGAAGTCGTGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCAAGGTTGGGTTTTGAATG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCAAGGTTGGGTTTTGAATG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.106 | 0.097 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAAGGTTGGGTTTTGAATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.150 | 0.044 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATTCAAAACCCAACCTTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.152 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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