GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-07 05:35:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS24012E09 KS24 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD119015.1:365-384
AAGAAGGGATCATTACCATAATCCCAAATA365TCAGCAGGCGGGTAATTATCATCACCATTAGGCCACAAAACCGGATACCC
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig15542, mRNA sequence.
JW065786.1:333-352
AAGAAGGGATCATTACCATAATCCCAAATA333TCAGCAGGCGGGTAATTATCATCACCATTAGGCCACAAAACCGGATACCC
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 3, sequence.
AP026698.1:168588823-168588842
AAGAAGGGATCATTACCATAATCCCAAATA168588823TCAGCAGGCGGGTAATTATCATCACCATTAGGCCACAAAACCGGATACCC
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 3.
CP124729.1:121717402-121717421
GGGTATCCGGTTTTGTGGCCTAATGGTGAT121717402GATAATTACCCGCCTGCTGATATTTGGGATTATGGTAATGATCCCTTCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCAGCAGGCGGGTAATTATC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCAGCAGGCGGGTAATTATC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.222 | 0.213 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAGCAGGCGGGTAATTATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.238 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATAATTACCCGCCTGCTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.239 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).