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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-20 08:45:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Medicago truncatula strain A17 clone mth2-67b7, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces.
AC155894.6:114605-114625
CACGCCATTTGCTTTACCTTCCCATCAGAG114605TCCAGGACGCTATCAAGCGCATAGCCATAGTCATATGTCAGCTCCTGCAAG
Medicago truncatula clone mth2-130l15, WORKING DRAFT SEQUENCE, 60 unordered pieces.
AC229691.8:137167-137187
CACGCCATTTGCTTTACCTTCCCATCAGAG137167TCCAGGACGCTATCAAGCGCATAGCCATAGTCATATGTCAGCTCCTGCAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCCAGGACGCTATCAAGCGCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCCAGGACGCTATCAAGCGCA | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.092 | 0.084 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCAGGACGCTATCAAGCGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.108 | 0.015 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCGCTTGATAGCGTCCTGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.108 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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