GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-04 03:35:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Sciurus carolinensis genome assembly, chromosome: 6.
LR738595.1:153231281-153231300
CCCAGGACATAAAACTTGAGGCAGGGCCTC153231281TGACACAAGAAGGCACAAGGTCAACAGTTCTTTGTTCATCTCTCTACTCT
Arachis hypogaea DNA, clone: NYHA00A22, cultivar: Nakateyutaka.
DE998914.1:151-170
GGGAGTAGTTGAAGTTTATCACCTTCATAT151CCTTGTGCCTTCTTGTGTCAACAATTTGGGTGGAATCAGGGTATGGGCAC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B07.
CP030999.1:126847444-126847463
GGGAGTAGTTGAAGTTTATCACCTTCATAT126847444CCTTGTGCCTTCTTGTGTCAACAATTTGGGTGGAATCAGGGTATGGGCAC
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 07.
CP049898.1:127616860-127616879
GGGAGTAGTTGAAGTTTATCACCTTCATAT127616860CCTTGTGCCTTCTTGTGTCAACAATTTGGGTGGAATCAGGGTATGGGCAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGACACAAGAAGGCACAAGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGACACAAGAAGGCACAAGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.097 | 0.088 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGACACAAGAAGGCACAAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.135 | 0.038 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTTGTGCCTTCTTGTGTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.137 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).