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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-04 08:10:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL031a09_r, 5'end.
AU192448.1:301-320
ACGCTTGTGTCAGAGTCTGTCGTGCCGCCC301TCAGAGGCTGTAGCGAGTCATGCCTCTTGGTCGGTGAAGCCTGTCGTGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGACTCGCTACAGCCTCTGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGACTCGCTACAGCCTCTGA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.105 | 0.097 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGACTCGCTACAGCCTCTGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.134 | 0.029 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCAGAGGCTGTAGCGAGTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.135 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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