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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-20 08:39:54, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Medicago arabica genome assembly, chromosome: 7.
OX326970.1:19067667-19067687
CAAACGTATTTTTGGATCCAAACATACATT19067667TGCAATGGTATTTTCATAGCGAAAAATAGAAGCTCGTGATCTCCGCGTCCT
Medicago truncatula chromosome 2 clone mth2-89f22, complete sequence.
AC174468.2:62248-62268
TCATTAATTTCAAATTATACCCCTATTTTT62248CGCTATGAAAATACCATTGCAAGTGTAAGTTTGCATCCAAAAATATGTTTG
Medicago truncatula chromosome 5 clone mth2-57p20, COMPLETE SEQUENCE.
CU459035.1:8089-8109
TCATTAATTTCAAATTATACCCCTATTTTT8089CGCTATGAAAATACCATTGCAAGTGTAAGTTTGCATCCAAAAATATGTTTG
Medicago sativa cultivar WL-525HQ cryptochrome 1 (CRY1) gene, partial cds.
GQ373159.1:1971-1991
TCATTAATTTCAAATTATACCCCTATTTTT1971CGCTATGAAAATACCATTGCAAATATATGTTTGGATCCAAAAATACGTTTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGCAATGGTATTTTCATAGCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGCAATGGTATTTTCATAGCG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.091 | 0.082 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCAATGGTATTTTCATAGCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.109 | 0.018 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGCTATGAAAATACCATTGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.111 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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