GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-15 19:44:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Trifolium repens mRNA, clone: WCC27p02_032, unspecified EST.
FY463773.1:2-23
T2TGGAGTCGAACTGATATCAACCCTTGTGACAAAACTCATTATCATCATCATC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 06_0cc.
CP125846.1:27213080-27213101
AAACAACGAAACTGAAGCAGCTTAGTGAAT27213080TGGAGTCGAACTGATATCAACCCTTGTGACAAAACTCATTATCATTATCATC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 06_Pall.
CP125847.1:21736690-21736711
AAACAACGAAACCGAAGCAGCTTAGTGAAT21736690TGGAGTCGAACTGATATCAACCCTTGTGACAAAACTCATCATCATCATCATC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGAGTCGAACTGATATCAACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGAGTCGAACTGATATCAACC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.190 | 0.181 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGAGTCGAACTGATATCAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.205 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTTGATATCAGTTCGACTCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.205 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).