GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-18 05:37:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Trifolium repens mRNA, clone: WCC20j13, unspecified EST.
FY461162.1:350-370
GTCGGATCCATGGTTCCTTTCTCTCTCCGA350TGGCTTCATGCTCTAATTCCGATCAAATTAGGTCAACGCCAACAAGGAATT
Trifolium fragiferum genome assembly, chromosome: 6.
OX940794.1:54897652-54897672
GTCGGATCCATGGTTCCTTTCTCTCTCCGA54897652TGGCTTCATGCTCTAATTCCGATCAAATTAGGTCAACGCCAACAAGGAATT
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 03_Occ.
CP125840.1:30835391-30835411
AATTCCTTGTTGGCGTTGACCTAATTTGAT30835391CGGAATTAGAGCATGAAGCCATCGGAGAGAGAAAGGAACCATGGATCCGAC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 03_Pall.
CP125841.1:34567711-34567731
AATTCCTTGTTGGCGTTGACCTAATTTGAT34567711CGGAATTAGAGCATGAAGCCATCGGAGAGAGAAAGGAACCATGGATCCGAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGCTTCATGCTCTAATTCCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGCTTCATGCTCTAATTCCG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.161 | 0.152 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGCTTCATGCTCTAATTCCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.178 | 0.017 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGGAATTAGAGCATGAAGCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.179 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).