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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-15 08:08:05, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RS2BO91TF RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 5', mRNA sequence.
EX894901.1:569-590
ACTGGTCTTGATTGGCAGGCTCGGAGCGGT569TGTGCCTTTGATGGAACTATCGAAGAATGGAACAGAGAGAGGGCAAAAGAAA
TSA: Brassica rapa x Raphanus sativus RNA, contig: BB3_81504.
FX779631.1:239-260
ACTGGTCTTGATAGGCAGACTCGGAGCGGT239TGTGCCTTTGATGGAACTATCGAAGAATGGAACAGAGAGAGGTCAAAAGAAA
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 1.
LR778310.1:40202588-40202609
ACTGGTCTTGATAGGCAGACTCGGAGCGGT40202588TGTGCCTTTGATGGAACTATCGAAGAATGGAACAGAGAGAGGTCAAAAGAAA
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 6.
OY743212.1:40202588-40202609
ACTGGTCTTGATAGGCAGACTCGGAGCGGT40202588TGTGCCTTTGATGGAACTATCGAAGAATGGAACAGAGAGAGGTCAAAAGAAA
RS2BO91JQ RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 3', mRNA sequence.
EX899154.1:229-250
TTTCTTTTGCCCTCTCTCTGTTCCATTCTT229CGATAGTTCCATCAAAGGCACAACCGCTCCGAGCCTGCCAATCAAGACCAGT
TSA: Raphanus sativus var. sativus RNA, contig: WG3_10462.
FX670919.1:156-177
TTTCTTTTGCCCTCTCTCTGTTCCATTCTT156CGATAGTTCCATCAAAGGCACAACCGCTCCGAGTCTGCCTATCAAGACCAGT
TSA: Raphanus sativus RS11222 mRNA sequence.
JT795769.1:194-215
TTTCTTTTGCCCTCTCTCTGTTCCATTCTT194CGATAGTTCCATCAAAGGCACAACCGCTCCGAGTCTGCCAATCAAGACCAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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